【加拿大乐活网lahoo小蒙编辑】来自英国剑桥大学和德国的研究人员利用基因网络技术，重建了人体内新冠病毒的早期“进化路径”随着感染从武汉扩散到欧洲和北美。
据剑桥大学最新研究，剑桥大学病毒团队通过分析第一批160个完整的病毒基因组，科学家们已经绘制出了一些新的冠状病毒通过其突变的原始传播，这些突变产生了不同的病毒谱系。“现在病毒变异速度太快了，很难精确地追踪到一棵新冠病毒系谱树。我们使用计算机算法来可视化所有可能性，”剑桥大学的首席作者、遗传学家彼得·福斯特博士说。“这些技术最早用于通过DNA来绘制史前人类的运动轨迹。
研究小组使用了从2019年12月24日至2020年3月4日期间从世界各地采集的病毒基因组数据。
这项研究展示了新冠病毒的三个不同的“变种”，由一串串紧密相关的世系组成，它们分别被标记为“A”、“B”和“C”。A类病毒与在蝙蝠和穿山甲中发现的病毒类型最为接近，研究人员称其为“疫情的根源”。B类病毒从A类经由两次突变而来，而C类又来自于B类。福斯特和同事们发现，与在蝙蝠体内发现的新冠病毒最接近的一种类型-A型，即“原始病毒基因组”。 最早A型病毒是从一名居住在武汉的美国人身上发现的，同时该病毒本身也在美国和澳大利亚的大量感染者中检测到，但令人惊讶的是，A型并不是武汉城市的主要病毒类型。
武汉的主要病毒类型B型病毒，普遍存在在东亚各地的患者中。然而，研究人员说，这种变异并没有传播到该地区以外的地方，没有进一步的变异。这意味着在武汉出现了“创始者”事件，或者对东亚以外的这种新冠病毒产生了“抵抗”。 研究人员认为，“B型病毒可以在免疫学或环境方面适应东亚大部分人群特征。”但这还不能证明海外华人对A型和C型感染率低，还需要进一步的研究来验证。
“C”型是主要的欧洲型，在法国、意大利、瑞典和英国的早期患者中发现。该研究在中国大陆的样本中没有发现C型病毒，但在新加坡、香港和韩国发现了。
重要的是，研究人员说他们的基因网络技术准确地追踪了已建立的感染途径：突变和病毒谱系连接了已知病例之间的关系。研究人员还表示，新冠肺炎的首例感染病例和人际传播或可最早追溯至2019年9月中旬至12月初
因此，科学家们认为，这些系统网络分析（Phylogenetic network analysis ）方法可以应用于最新的冠状病毒基因组测序，以帮助预测未来全球疾病传播和激增的热点。
福斯特说：“系统网络分析有可能帮助确定未经证实的新冠病毒感染源，然后可以对其进行隔离，以遏制该疾病在世界范围内的进一步传播。”
该研究成果已经发表在今天的《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。
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本文发布于： 2020-4-11 10:28
