美中学术交流自1978年开始持续合作数十年，自华府视北京为战略竞争对手、日益担心中国间谍活动后，原本不太受两国关系波动影响的学术合作，每况愈下。专家表示，美中学术合作走下坡，伤害学生和研究人员，也将削弱美国竞争力。
在美国的中国学生数量下降，美中研究合作萎缩；因担心小失误可能导致职涯终结，学者们也回避可能涉及中国的计划。前美国驻北京外交官、维拉诺瓦大学(Villanova University)政治科学家塞利格森(Deborah Seligsohn)说：「这对美国科学确实有害；我们的科学成果正在减少。」
川普政府司法部基于科学进步前景须以安全为先的担忧，2018年启动「中国行动计划」(China Initiative)，旨在揭露经济间谍活动；虽未能抓获任何间谍，却已对美国学校研究人员产生影响。拜登政府2022年终止「中国行动计划」，但与中国有联系的学者、甚至于中国学生，仍可能被当成「眼中钉」。
美联社报导，订年底在美国国家科学院院刊(PNAS)发表的研究，分析PubMed数据库论文发现，截至2021年，美中科学家合作撰写论文数量仍多于他国科学家，但与中国有关的科学家的合作自2019年开始下滑。以引用次数衡量，与中国有关连的在美学者影响力下降10%。
「在科学方面已产生寒蝉效应」，该研究首席研究员贾瑞雪(Ruixue Jia)说：「研究人员仍试图完成现有合作项目，但不愿开始新项目，情况可能会更糟。两国都受害。」
根据佛州旨在遏制外国影响的州法，来自中国的学生可能会被禁止进入该州公立大学实验室。因担心北京通过学生团体影响美国校园，一群共和党参议员12月敦促司法部考虑将此类团体登记为外国代理人。
哈德逊研究所中国中心主任余茂春(Miles YU)则表示，北京利用美国高等教育和研究机构实现经济和军事现代化，「有段时间，许多人出于文化和利益因素，持双重忠诚，误以为可同时为美国和中国利益服务。」
与此同时，美中两国1979年签署的第一项重大协议「中美科技合作协议」预计今年失效；国会8月将协议延长半年，但它的未来仍悬而未决。
美国驻中国大使伯恩斯表示，目前在中国留学的美国学生只有700人，在美国的中国学生近30万人；2019-2020年的峰值约37万2000人。
