1月2日，就在胡鑫宇失踪81天时，警方声称“排除校内人员犯罪可能”、“可能是有厌学情绪，自行出走了”。与此同时网络上流传着数十种猜测，甚至出现“学校的化学老师杀人”、“校方跟团伙合作盗走器官”等传言。
胡鑫宇失踪后警方调取校内外监控均未发现其身影，也没有发现他离开校园的线索，家属因此质疑视频遭到了人为删减，但警方的回应却与监控公司方面存在出入，这更引起了网民的质疑。
就在胡鑫宇遗体被发现之前，警方宣称曾进行了多次大规模搜寻，先后出动上千人进行拉网式搜索，甚至抽干了一条小溪，仍未发现死者。1月7日，上饶公安发布《致网民朋友的一封信》，信中称“警方联合多部门及社会力量搜索了学校南侧树林山岗约589亩等地…..未发现有价值线索”。
在胡鑫宇的遗体被发现之后，网民对于此前警方通报的质疑更甚——为何上千人搜山也没找到胡鑫宇遗体？尸体发现地就是第一案发现场吗？总之，这一离奇的“灯下黑”让案情变得更为蹊跷、难以解释。目前，在微博平台上与胡鑫宇案件相关的新闻下充斥着网友的批评、质疑言论。
截至发稿前，澎湃新闻发布的一篇报道披露，胡鑫宇遗体所在的仓库内区域并未被认真搜索：
接近调查的一位知情人士证实，遗体确实是在仓库内的一处树林中发现的，之前大面积搜寻时曾询问过仓库工作人员，得知并未发现有外人进入后，就没有进入仓库内部搜寻。遗体是狗发现的，仓库有较高的围墙，现场勘验发现围墙上有攀爬痕迹，人或许是沿围墙外边的土堆攀爬进入的。
以下为中国数字时代编辑摘自微博网友评论：
全民记：万人寻他千百度，暮然回首百米处。
飒飒江风162：尸体在搜救人员过来时就躲在草丛中捉迷藏，他们走了就吊在树上荡秋千。
Dangerry-：之前：发动5000人地毯式搜索。 现在：问了一下没人进就没去搜。
少女们：真的漏洞百出。
海白慕林：讲个笑话，地毯式搜索，一百天，村民，找鸡找到了。
转身未来sss：地毯式，仓库把地毯戳破了。
云之竹歌：看来我们对“地毯式搜索”这个词，理解很不一样。
鬼璽：生前躲过了所有监控，死后又躲过了所有搜索。
小乌龟慢慢扒：我从来不认为这个事件有什么阴谋诡计。但一会有搜查痕迹，一会没搜查过，遗体就在几百米内能找尼玛100多天；当地警察确实是够无能的！省厅下去督察是只听当地警方做汇报了？
荣光焕发的人民：先不管有没有黑幕，当地警方的能力已经被证实是依托答辩了，最终也没能找到，还是群众发现的。
东莞曹富贵：一件并不复杂的人口失踪案，硬是让它们玩成了举世瞩目的世纪悬疑片；面对频繁不断地刷屏的各种质疑，它们全当视而不见，甚至受害家属的感受及广大群众的智商全都不在考虑之列； 唏嘘之余一个字：服！！！
阿宁很优秀_：问一下，已经公开DNA是胡，也尸检过了，器官也还在吗？在的话也是正常腐烂的吗？好多人关心这个，这个种可以公开的吧？
想养老的每一天：人搜不到，警犬还能出错哦？
穹顶之上话玄学：又是衣服反穿，又是缢吊的，找了几个月，就在学校后山。有当年Red cloth boy内味儿了……别告诉博主最后结论也和当年一样…..
只此trader：别提认真，认真了一百多天去寻找结果是灯下黑。
融媒体张灏：2022最诡异事件。如果无法给民众一个令人信服的交代，我看此事会再一次让执法部门的公信力受损。
炎悦-33：离学校很近，里边地方很大，有小树林。围墙外边的沙堆踩着能翻越。这些还不够理由进去仔细搜吗？太能打马虎眼了。
毛墨玩家:大家为什么会去猜测，我觉得是公信力缺失造成的。
一鹤行之：这案件始终透出一种诡异。
Music_Bling ：不管结局如何，负责搜救工作的官员难逃其责。失踪范围内那么大一个粮仓，仅凭覆盖不完整的几个监控就判定无人进入而不搜查，是重大过失；在粮仓外部围墙没有发现其攀墙进入的痕迹，也是工作不仔细；近在咫尺的围墙内的尸体，搜救犬和人都没有发现，说明搜救工作非常粗糙潦草。
普法达人张三：某乎匿名网友，昨晚说的部分细节，与媒体报道吻合。
